Acesse o terminal SSH do VPS e digite os comandos abaixo:
rm -fv csf.tgz
wget http://www.configserver.com/free/csf.tgz
tar -xzf csf.tgz
cd csf
sh install.sh
Por padrão o CSF vem com o modo de teste ativado, você deve desativar em sua configuração. Caso use cPanel em seu servidor, o CSF será listado em plugins.